Investigadores del CSIC han desarrollado FungAMR, una base de datos innovadora que compila más de 50.000 entradas y 35.000 mutaciones genéticas en 95 especies de hongos, abordando la creciente resistencia a los antifúngicos, un problema crítico para la salud global. Este recurso, que incluye información sobre 208 antifúngicos y se basa en más de 500 estudios científicos, permite evaluar la fiabilidad de las mutaciones asociadas a la resistencia. Además, han creado ChroQueTas, un software libre para analizar genomas fúngicos y detectar automáticamente estas mutaciones. Ambos proyectos son esenciales para mejorar la vigilancia y el tratamiento de infecciones fúngicas, destacando la necesidad urgente de nuevas terapias.
La resistencia a los antifúngicos se ha convertido en una creciente preocupación para la salud global, un problema que ha sido recientemente elevado a la lista de prioridades sanitarias de la Organización Mundial de la Salud (OMS). A pesar de su relevancia, los hongos han sido objeto de menor atención en comparación con las bacterias dentro de los programas de vigilancia y desarrollo farmacéutico, lo que ha llevado a importantes pérdidas en cultivos agrícolas y un impacto clínico significativo.
Aunque el avance en la secuenciación masiva de ADN ha permitido progresos notables en el estudio del microbioma y la resistencia a antibióticos, la investigación sobre la resistencia a antifúngicos enfrenta obstáculos considerables. La falta de bases de datos completas, junto con la complejidad del genoma eucariótico, dificulta el análisis in silico y a gran escala.
Para abordar este desafío, un equipo internacional liderado por el Instituto de Biología Funcional y Genómica (IBFG, CSIC–USAL), junto con la Universidad de Salamanca y la Université Laval en Canadá, ha desarrollado FungAMR. Esta base de datos innovadora compila más de 50.000 entradas y 35.000 mutaciones genéticas asociadas a 95 especies de hongos, relevantes desde perspectivas clínicas, agrícolas y ambientales. Estas mutaciones están vinculadas a 246 proteínas que confieren resistencia a un total de 208 antifúngicos.
La información contenida en FungAMR ha sido meticulosamente extraída manualmente de más de 500 estudios científicos, clasificada según el nivel de evidencia experimental. Esto permite a los investigadores evaluar la fiabilidad y respaldo científico detrás de cada mutación. El trabajo fue publicado recientemente en la revista Nature Microbiology.
"La motivación detrás de FungAMR era la necesidad apremiante de contar con una base de datos exhaustiva y confiable sobre los mecanismos de resistencia a antifúngicos", explica Christian R. Landry, investigador en Université Laval. La interfaz web amigable e intuitiva facilita su uso por parte del público interesado.
Además, el equipo ha creado el software ChroQueTas, una herramienta bioinformática pionera que permite analizar genomas y proteomas fúngicos, identificando automáticamente las mutaciones responsables de resistencia a antifúngicos. Este software libre ofrece un cribado genético rápido, preciso y escalable para cepas clínicas y ambientales.
"En nuestras pruebas con genomas previamente publicados, ChroQueTas ha identificado confiablemente las mutaciones ya descritas, así como nuevas mutaciones no reportadas anteriormente", señala Narciso M. Quijada, investigador del IBFG. Esto demuestra el potencial del software como herramienta clave para la vigilancia genómica.
El estudio revela que muchas mutaciones pueden conferir resistencia a múltiples antifúngicos simultáneamente —un fenómeno conocido como resistencia cruzada. Este fenómeno es impulsado por el uso extensivo de antifúngicos en agricultura, especialmente azoles, lo cual representa una presión evolutiva significativa. Esta situación complica el tratamiento adecuado de infecciones fúngicas y subraya la urgencia en desarrollar nuevas terapias con mecanismos alternativos.
| Cifra | Descripción |
|---|---|
| 50,000 | Entradas en la base de datos FungAMR |
| 35,000 | Mutaciones genéticas identificadas |
| 95 | Especies de hongos de interés clínico, agrícola y ambiental |
| 246 | Proteínas asociadas a la resistencia a antifúngicos |
| 208 | Antifúngicos a los que confieren resistencia |
FungAMR es una base de datos que recopila más de 50.000 entradas y 35.000 mutaciones genéticas identificadas en 95 especies de hongos de interés clínico, agrícola y ambiental, asociadas a 246 proteínas que confieren resistencia a un total de 208 antifúngicos.
ChroQueTas es una herramienta bioinformática que permite analizar genomas y/o proteomas fúngicos y detectar automáticamente mutaciones que confieren resistencia a antifúngicos, facilitando el cribado genético de cepas clínicas y ambientales de forma rápida, precisa y escalable.
La resistencia a los antifúngicos es una amenaza creciente para la salud global y puede dificultar el tratamiento de infecciones fúngicas. La investigación en este campo es crucial para desarrollar nuevas terapias con mecanismos de acción alternativos.
FungAMR ya está disponible como interfaz web dentro del portal del Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD) y se actualizará periódicamente con nuevos datos.
La información en FungAMR ha sido extraída manualmente de más de 500 estudios científicos y clasificada rigurosamente según el nivel de evidencia experimental.